Voor de bedrijfslocatie van transportbedrijven gelden verschillende milieuregels. Deze vallen allemaal onder de Wet milieubeheer (Wm). Voor de meeste transportbedrijven zijn deze nader uitgewerkt in het Activiteitenbesluit.

Geluidsoverlast bij transportbedrijven wordt voornamelijk veroorzaakt door vrachtwagens die 's morgens vroeg de motor laten warmlopen of luchtdraaien, het draaien van koelaggregaten, af- en aanrijden of eventueel door overslag van goederen. Voor de meeste transportbedrijven zijn de geluidseisen vastgelegd in het Activiteitenbesluit Milieubeheer

In waterleidingen kan onder bepaalde omstandigheden de legionella-bacterie tot ontwikkeling komen. Deze bacterie kan vervolgens via verneveling van het water tot infectie bij mensen leiden. Daarom is hiervoor regelgeving ontwikkeld